Misje są najważniejszą częścią gry. Opierają się na zasadach sesji rpg, czyli tekstowego opowiadania swoich poczynań nadzorowanych przez mistrza gry (prowadzącego misję). Misję wykonuje się w dziale twojej wioski.

1.Podział misji.
- Rangi E - Można wykonywać od Ucznia Akademi
- Rangi D - Można wykonywać od Ucznia Akademi
- Rangi C - Można wykonywać od Ucznia Akademi
- Rangi B - Można wykonywać od Chuunina
- Rangi A - Można wykonywać od Jounina
- Rangi S - Misje Eventowe, dozwolone dla każdego

2.Misje eventowe.
Misje rangi S, które co jakiś czas pojawiają się na forum. Są zazwyczaj trudne i powinni je wykonywać min. Jounini.

2.Jak wykonać misje.
Misję można wykonać zespołowo, lub indywidualnie (zalecamy grę zespołową). Tworzymy wątek w dziale Misje shinobi o tytule: Misja rangi ranga misji dla wasz wasze nicki. Treść tematu taka sama jak tytuł. Następnie czekacie na odpowiedź prowadzącego misje (Misję można prowadzić od Jounina.